股权投资基金主要涉及增值税、所得税两大税种。增值税方面，基金管理费按6%（一般纳税人）或3%（小规模纳税人）缴纳；股权转让收益通常不缴纳增值税，但契约型基金份额转让需按6%或3%缴税。所得税处理差异较大：公司型基金需缴纳25%企业所得税；合伙型基金实行"先分后税"原则，法人合伙人缴25%企业所得税，个人合伙人按20%缴个人所得税；契约型基金中法人投资者缴25%企业所得税，个人投资者缴20%个人所得税。创投企业可选择单一投资基金核算（20%固定税率）或年度整体核算（5%-35%累进税率）。

这一税收框架的形成源于我国对股权投资行业的政策引导。从法律层面看，《合伙企业法》明确合伙企业的税收穿透特性，奠定了"先分后税"原则的基础。财税[2008]159号文进一步细化规定，要求合伙企业所得在合伙人层面征税。对于创投企业，财政部2023年24号公告延续了税收优惠政策，允许选择单一基金核算方式，将个人合伙人税负锁定在20%，显著低于常规经营所得的最高35%税率。在增值税领域，财税[2016]36号文将金融服务纳入营改增范围，但明确股权转让不属于金融商品转让，这一界定使得合伙型和公司型基金的股权转让收益免缴增值税。值得注意的是，股息红利所得存在特殊处理：居民企业间的股息红利免税，而个人通过基金取得的股息红利需按20%征税，但持股超1年可享受免税优惠。这些政策组合体现了国家对股权投资行业"重实质、轻形式"的监管思路，既保持税收中性，又通过差异化管理引导资金流向实体经济。当前广东省等地方出台的基金管理办法，也强调要加强财政出资与税收政策的协同，这预示着未来税收政策可能进一步向支持科技创新和产业升级的基金倾斜。