通过沪港通/深港通投资港股通标的基金，个人投资者取得的转让差价所得目前暂免征收个人所得税，而股息红利所得则需按20%税率缴纳。这一政策延续自2023年财政部公告，有效期至2025年12月31日。基金管理人层面需缴纳增值税及企业所得税，其中公募基金转让金融商品差价收入暂免增值税。

当前税收政策依据主要来自三方面：一是财政部2023年8月明确延续的跨境投资税收优惠，规定内地个人通过港股通投资香港上市股票的资本利得继续免税；二是证券投资基金税收管理规则，要求基金运营中产生的增值税由管理人按3%简易计税；三是个人所得税法实施条例，将证券投资股息红利纳入分类征税范畴。值得注意的是，政策对资本利得与股息红利实施差别化处理，前者免税旨在鼓励长期持有，后者征税则体现对投资收益的调节。2025年6月最新数据显示，该政策使内地投资者港股通年均交易成本降低约15%，但税务部门也加强了对跨境收益的申报监管，近期北京、上海等地已开展专项核查。未来随着2025年底政策到期日的临近，市场预期可能出台新的税收衔接安排。