运输劳务主要缴纳增值税。根据现行税法规定，交通运输服务属于增值税应税范围，一般纳税人适用9%税率，小规模纳税人适用3%征收率。

运输劳务缴纳增值税的原因可以从税法原理和政策沿革两个维度分析。从增值税本质看，它是对商品和劳务在流转环节中的增值额征税。运输服务作为物流环节的重要组成部分，在商品从生产到消费的流通过程中创造了价值增量。这种增值体现在空间位移带来的商品效用提升和时间价值变化上。我国《增值税暂行条例》明确规定，在境内提供交通运输服务的单位和个人为增值税纳税人。从历史沿革看，运输业征税经历了营业税向增值税的转型过程。2013年8月1日起，全国范围内实施交通运输业"营改增"试点，将原征收3%营业税的运输服务纳入增值税体系。这一改革消除了重复征税问题，使增值税抵扣链条在运输环节得以贯通。根据财政部、国家税务总局联合发布的财税〔2013〕37号文，交通运输服务被明确列为增值税应税服务范围。现行政策下，运输劳务增值税处理具有三个特征：一是区分纳税人类型适用差异税率，一般纳税人提供运输服务按9%计税，小规模纳税人按3%简易征收；二是进项税额抵扣制度，一般纳税人可凭合法扣税凭证抵扣相关进项税；三是特殊业务区分，如程租、期租业务按交通运输服务9%计税，而光租、干租业务则归入有形动产租赁服务适用13%税率。这种税制设计既考虑了运输行业的经营特点，也保持了增值税中性原则，有利于促进物流业专业化分工和降本增效。需要注意的是，除增值税外，运输合同还涉及印花税，双方需按合同金额万分之五贴花。但印花税属于行为税范畴，与针对劳务增值额征收的增值税具有本质区别。