稀土企业销售稀土产品需按照增值税一般纳税人或小规模纳税人身份缴纳增值税。一般纳税人适用13%税率，需通过增值税发票管理系统开具左上角标注"XT"字样的稀土专用发票，货物名称栏必须从稀土产品目录选择，单位栏选择公斤或吨，数量栏按折氧化物计量填写。小规模纳税人适用3%征收率，月销售额不超过10万元可免征增值税。销售稀土矿产品、冶炼分离产品等不同品类需分别开具发票，不得与非稀土产品或劳务混开。

这一税收政策源于国家对稀土这一战略资源的特殊管理要求。2019年国家税务总局发布第13号公告，明确停用增值税防伪税控系统汉字防伪项目，要求稀土企业必须通过升级后的发票管理系统开具专用发票，并在发票上体现稀土产品的计量特征。该规定旨在通过税收征管手段强化稀土产业链的规范管理，防止稀土资源无序流通。从会计核算角度看，稀土企业需在"应交税费-应交增值税"科目下设专栏核算销项税额，月末通过"转出未交增值税"科目结转应纳税额。对于享受即征即退等税收优惠的，还需按财政部《增值税会计处理规定》将退税款计入"其他收益"科目。值得注意的是，2023年小规模纳税人减免增值税政策延续后，月销售额不超10万元的稀土贸易企业可继续享受免税优惠，但若选择开具增值税专用发票则需放弃免税。这些征管要求既体现了增值税"道道征收、税不重征"的基本原则，也反映了国家对稀土这一战略性资源实施税收调控的特殊考量。