银行50万元存款保险资金主要来源于金融机构缴纳的保费。根据我国《存款保险条例》规定，投保机构需按一定比例向存款保险基金缴纳保险费，这是保障资金的最主要来源。存款保险基金还通过清算分配财产、投资收益等渠道获得补充资金。

这一制度设计的核心逻辑在于构建市场化风险分担机制。从国际经验看，存款保险基金通常采用"事前积累"模式，即通过日常收取保费建立资金池。我国存款保险基金自2015年建立以来，已形成稳定多元的资金来源体系。金融机构缴纳的保费采用风险差别费率，高风险机构需支付更高保费，这既体现了公平性原则，也强化了银行的风险约束。截至2024年底，保险业资金运用余额已突破33万亿元，其中债券配置占比超50%，为存款保险基金提供了稳定的投资收益来源。从资金运用角度看，存款保险基金主要配置于银行存款、高等级债券等低风险资产，确保赔付能力的稳定性。值得注意的是，50万元赔付限额并非静态指标，而是会根据经济发展水平和金融风险状况动态调整。这种设计既考虑了覆盖99%以上储户的实际需求，又为基金可持续运作留有空间。从本质上看，存款保险制度通过"银行付费、储户受益"的模式，在市场化原则下实现了金融安全网的构建。