阿里员工行权缴税需分两步计算：首先按行权日股票市价与行权价的差额乘以股票数量，得出应纳税所得额；其次将该所得并入当年综合收入，适用3%-45%超额累进税率。若符合递延纳税条件（如非上市公司期权），可暂缓至股权转让时按20%财产转让所得税率缴税。

这一计算依据主要来自财税政策对股权激励的专项规定。根据《财政部 国家税务总局关于个人股票期权所得征收个人所得税问题的通知》（财税〔2005〕35号），员工行权时实际购买价低于市场价的差额，需按"工资、薪金所得"计税。具体公式为：（行权日每股市价-行权价）×股票数量，该金额需与当年工资收入合并后适用累进税率。例如，若阿里员工以每股10元行权价购入市价20元的股票1000股，则应税所得1万元需叠加至年度总收入中核算税款。

对于非上市公司期权，财税〔2016〕101号文允许符合条件者递延纳税，即在行权时不缴税，待未来股权转让时按20%税率计税。但阿里作为上市公司，其员工通常需在行权时立即纳税。实际操作中，阿里会向税务机关报送期权计划、行权通知书等材料，员工需通过"全年一次性奖金"或"综合所得"方式申报。若涉及外币结算（如阿里美股期权），需按汇率折算为人民币计税。

现行税法对股权激励的税务处理具有双重考量：一方面通过累进税率调节收入分配，另一方面通过递延政策鼓励长期持股。2025年金税四期系统上线后，税务机关可通过区块链技术追踪行权与转让全流程，企业需确保四流（合同、发票、资金、物流）一致以避免稽查风险。员工行权前应充分测算税负，例如分批行权可避免税率跳档，而持有满一年后再出售可能享受更低资本利得税。