茶叶增值税的计算主要分为三种情况：自产自销免税、外购加工按13%税率征税、混合经营需分别核算。农业生产者销售自产毛茶免征增值税；外购茶青加工销售按初级农产品13%税率计税；若企业同时涉及自产和外购业务，须严格区分销售额，否则全部从高适用税率。

这一税收政策源于我国对农业产业链的差异化扶持。根据《中华人民共和国增值税法》及配套文件，自产农产品免税旨在降低农业生产者负担，而加工环节征税则体现增值税"环环抵扣"的特性。对于初制茶叶企业，若拥有自有茶园，其毛茶销售属于《增值税法》第六条规定的免税范围；但外购原料加工的企业，因不属于农业生产者，需按13%税率缴纳增值税，并可抵扣茶青收购发票注明的13%进项税额。混合经营企业须特别注意税务风险，根据国家税务总局公告要求，未分别核算销售额的将全额按13%计税。实务中，精制茶及深加工产品可能适用更高税率，如茶饮料通常按一般货物16%税率计税。边销茶作为特殊品类，财政部2023年59号公告明确对名单内企业免征增值税至2027年底，体现国家对边疆贸易的政策倾斜。税收征管层面，小规模纳税人可选择简易计税按6%征收率纳税，但不得抵扣进项税。这些规定共同构成了茶叶行业增值税的完整政策框架，企业需根据自身业务形态准确适用。