股东发现证券违规行为可通过以下途径实名举报：1.拨打证监会12386服务热线；2.登录证监会官网在线举报平台提交材料；3.向中国证券投资基金业协会官网或邮寄信件举报。举报需提供被举报方详细信息、违规事实证据及自身身份证明，监管部门对举报人信息严格保密。

该处理方案依据现行法规与监管实践制定。根据《证券期货违法违规行为举报工作暂行规定》，举报需满足三个条件：违规事项属于证券法规明确禁止的行为、提供被举报人完整信息、提交具体事实与客观证据。证监会2025年5月发布的投资者保护宣传日数据显示，2024年通过12386热线处理的举报中，32%涉及操纵市场，28%与信息披露违规相关，实名举报核查效率比匿名举报高40%。基金业协会《举报工作办法》明确三类接收途径，且要求15个工作日内反馈受理情况。实践中，如2025年慈星股份可交债违规案，正是通过实名举报触发调查，最终上海证监局对涉事机构作出处罚。需注意，举报若涉及民事纠纷应通过诉讼解决，而协会不受理业务咨询类投诉，该划分在《中国证券投资基金业协会投诉处理办法》第五条有详细说明。