米业行业主要涉及增值税和企业所得税两大税种。增值税方面，大米销售适用9%税率（一般纳税人），小规模纳税人按3%征收率；若企业外购稻谷加工销售，不能享受自产农产品免税政策。企业所得税标准税率为25%，但符合条件的初加工业务可免征，小型微利企业可减按20%征收。此外还可能涉及印花税、房产税等附加税种。

这一税收结构源于我国对农业产业链的差异化政策设计。增值税层面，财税[2019]39号公告明确粮食等农产品税率从11%降至9%，但对加工环节区分了自产与外购：农业生产者销售自产大米可免税，而外购稻谷加工销售需全额纳税，这体现了对农业生产端的扶持。企业所得税的优惠政策依据《企业所得税法》第27条及财税[2008]149号文，将稻谷清理、脱壳等初加工纳入免税范围，但精加工环节仍需纳税。实践中，2024年国家发改委粮食进口配额数据显示，532万吨大米进口中50%为国营贸易配额，这类政策性业务往往适用特殊计税规则。税收差异直接影响企业毛利率，例如采用"公司+农户"模式的企业通过前端免税可获得3-5%的成本优势，这在粮油加工行业平均净利率不足2%的背景下尤为关键。值得注意的是，2025年新修订的《增值税法》实施后，农产品深加工企业可享受进项税额加计抵扣，这对米业延伸产业链（如米粉、米制品加工）形成利好。税务筹划需重点关注三个节点：收购环节凭收购发票按9%抵扣、初加工业务免税备案、以及地方对农业产业化龙头企业的财政返还政策。