零售连锁店的纳税主要涉及增值税、企业所得税和个人所得税。根据现行税收政策，连锁店需在开业30日内完成税务登记，按月申报缴纳增值税，税率一般为3%或5%，同时需缴纳城市维护建设税和教育费附加。企业所得税税率为25%，符合条件的小微企业可享受优惠税率。连锁店若跨区域经营，可由总部统一申报缴纳增值税和企业所得税。

这一答案的依据来自多个权威税收政策文件。《中华人民共和国税收征收管理法》明确规定企业需在领取营业执照后30日内完成税务登记，这是所有连锁店必须遵守的基本法律义务。根据财政部、国家税务总局发布的《关于连锁经营企业有关税收问题的通知》，跨区域经营的连锁企业可由总机构统一申报缴纳增值税和企业所得税，这为连锁经营模式提供了税收便利。对于增值税的具体征收，零售行业一般纳税人税率为17%，小规模纳税人适用3%的简易征收率。企业所得税方面，《中华人民共和国企业所得税法》规定基本税率为25%，但高新技术企业可享受15%的优惠税率。对于月收入低于5000元的小型连锁店，可享受增值税免征政策，这体现了国家对小微企业的税收扶持。最新数据显示，2025年前4个月全国民营经济纳税人享受减税降费政策优惠达3518.8亿元，其中零售连锁企业作为民营经济的重要组成部分，同样受益于这些优惠政策。这些税收政策的制定和实施，既确保了国家税收的稳定，又为连锁经营企业的发展创造了良好的税收环境。