销售牛奶的增值税税率主要分为以下几种情况：鲜奶（包括巴氏杀菌乳、灭菌乳）适用9%税率；调制乳、酸奶等加工奶制品适用13%税率；个体工商户零售牛奶若符合小微企业标准，可适用3%征收率或免税政策。

关于牛奶销售增值税税率的差异，核心在于产品加工工艺与政策调整的历史沿革。根据现行税收法规，鲜奶作为初级农产品享受低税率政策。具体而言，符合《食品安全国家标准》的巴氏杀菌乳（GB19645）和灭菌乳（GB25190）被明确归类为初级农业产品，其增值税税率自2019年税率简并后调整为9%。这一政策依据源自国家税务总局2011年第38号公告，该文件首次明确两类乳制品可依照《农业产品征收范围注释》执行优惠税率。而调制乳（GB25191）因添加营养强化剂等加工工序，被排除在初级农产品范围外，适用13%标准税率。这种差异化处理体现了税收政策对农业初级产品的扶持导向，同时保持对深加工食品的常规课税原则。值得注意的是，2024年部分政策解读显示，鲜奶税率存在9%与13%的表述差异，这实际反映了税率调整的历史过程：2017年前鲜奶适用13%税率，2017-2018年降至11%，2019年最终调整为9%。对于零售环节，个体工商户销售牛奶若月销售额不超过10万元（季度30万元），可享受增值税免征优惠；超过标准的按1%简易征收，综合税负约2-4%。这种阶梯式税率设计既保障了基础民生需求，又确保了税收公平性。实务操作中需特别注意产品分类标准，例如超市常见的盒装纯牛奶若仅经灭菌处理仍属鲜奶范畴，而添加维生素D等营养素的调制乳则需适用更高税率。税务机关通常要求企业提供产品执行标准编号（GB编号）作为税率判定依据，因此准确识别产品类型是合规纳税的关键前提。