超市销售水果的增值税税率一般为9%。若为小规模纳税人，则适用3%的征收率；若将水果进行礼盒包装等深加工，则税率可能升至13%。

关于超市水果销售税率的确定依据，主要基于现行增值税政策对农产品流通环节的差异化规定。我国增值税体系对农产品实行特殊税收政策，旨在保障民生基本需求并促进农业产业链发展。根据财政部和国家税务总局联合发布的财税字〔1995〕52号文件，农产品流通环节适用9%税率，该政策在后续多次税制改革中保持延续性。2017年财税〔2017〕37号文件明确取消13%档税率后，水果作为初级农产品正式划归9%税率范畴。2019年深化增值税改革时，通过财政部税务总局海关总署公告2019年第39号再次确认该税率标准。实际操作中需区分纳税主体类型：一般纳税人销售未加工水果适用9%税率；小规模纳税人可选择按3%征收率简易计税，疫情期间曾阶段性下调至1%。特殊情形包括：农业生产者自产自销可享受免税政策；经深加工制成罐头等产品适用13%税率；礼盒包装若改变商品属性则需从高适用税率。税收征管实践中，税务机关主要依据《农业产品征税范围注释》判定商品归属，新鲜水果属于注释列举的免税或低税目。2025年最新增值税税率表显示，9%档位主要覆盖民生基础商品，与13%档的工业品形成差异化税率结构。纳税人需注意区分批发零售环节与生产环节的税收差异，同时关注地方税收优惠政策可能带来的实际税负变化。正确适用税率不仅关乎企业税务合规，更直接影响定价策略和市场竞争优势。