经济补偿金个税计算的关键在于是否超过当地上年职工平均工资3倍数额。若补偿金在该额度内（如上海2023年为443052元），则全额免征个人所得税；超过部分需单独适用综合所得税率表计税。例如50万元补偿金，超过部分56948元按10%税率计算，应纳税3174.8元。

经济补偿金的个税政策依据主要源自财税〔2018〕164号文件，其核心规则有三：一是设定免征门槛为当地社平工资3倍，该标准采用年度数据而非月度，例如上海2023年月均工资12307元对应年社平工资147684元；二是超额部分不并入综合所得，而是单独计税，避免因合并计税导致税率跳档；三是允许扣除实际缴纳的社保费用。实务中需注意三个细节：劳动合同到期不续签的补偿金不享受免税，必须并入工资薪金计税；破产企业的一次性安置费全额免税；工作年限超过12年时仍按12年计算平均月收入。不同地区执行口径存在差异，如江苏要求一次性计税，而厦门允许分摊至所属期间。计算示例显示，20万元补偿金在社平工资6万元的地区仅需缴税600元，而同等金额在社平工资5万元的地区则需缴纳2480元，体现地域差异性。企业会计处理时，需将补偿金计入"管理费用-辞退福利"科目，支付时代扣个税。该政策旨在平衡劳动者权益保障与税收公平，既避免高额补偿引发暴利，又保障普通离职者的基本权益。