个人股权转让所得税的计算公式为：应纳税额=(股权转让收入－股权原值－合理费用)×20%。其中股权转让收入包括现金、实物等经济利益，股权原值指取得股权时实际支付的价款及相关税费，合理费用涵盖印花税、评估费等转让过程中产生的必要支出。若转让价格明显偏低且无正当理由，税务机关有权核定收入。例如转让收入100万元、原值50万元、费用2万元时，需缴纳(100-50-2)×20%=9.6万元个税。

该计算依据源于《个人所得税法》对财产转让所得的明确规定。股权作为财产性权利，其转让收益适用"财产转让所得"项目，这区别于工资薪金或经营所得的累进税率，统一采用20%比例税率。扣除项的设定遵循税收中性原则：股权原值体现成本补偿，避免对投资本金重复征税；合理费用则考量交易真实性，防止虚增成本。税务机关对低价转让的核定权，主要针对利用亲属间无偿转让、阴阳合同等避税行为，具体标准包括低于净资产份额、初始投资成本或同业可比价格等情形。正当理由需提供法律文件证明，如政策性调整影响企业价值，或直系亲属间继承等特殊关系。实务中还需注意，分期收款需一次性计税，而印花税按转让价款万分之五单独缴纳。这种税制设计既保障财政收入，又通过差别化政策引导市场规范交易，例如对非上市公司股权免征增值税便旨在活跃中小企业投融资。当前政策延续了2024年以来的执行口径，未出现2025年税率调整的迹象，与综合所得最高45%的税率相比，20%的固定税率体现了对资本要素的适度优惠。