混改基金公司主要通过私募股权基金形式运作，聚焦国企混改项目投资。其核心运作模式包括：1）联合与国企设立专项基金，引入社会资本形成多元化股权结构；2）通过增资扩股或股权转让参与国企改革，通常持股比例在5%-30%之间；3）建立市场化管理机制，包括职业经理人制度与员工持股计划；4）整合产业链资源，推动被投企业技术升级与业务转型。典型案例如华能新能源通过混改基金引入国家绿色发展基金等战略投资者，资产负债率显著下降7.86个百分点。

这一运作模式的合理性源于三方面实证数据：国企混改私募基金已发展成为专业化的资本工具，其通过"混资本+改机制"双轮驱动，既能解决国企融资难题，又能优化治理结构。数据显示，2024年完成混改的无锡雷华网络技术公司，在引入私募基金后形成53.44%国有股与46.56%社会资本的股权结构，同步实施员工持股，企业治理效率显著提升。混改基金具有独特的资源整合优势，如中国建材集团通过混改基金收购泰山石膏35%股权，并联合民企成立梦牌新材料，最终实现石膏板产能整合1.9亿平方米，验证了产业协同效应。第三，政策层面明确将混改作为国企三年行动重点任务，2020-2025年全国混改企业数量年均增长17%，其中引入私募基金的项目成功率比传统混改高出23个百分点。这种专业化运作既符合"推动有效投资"的政策导向，又能通过市场化机制规避"为混而混"的形式主义风险，最终实现国有资产保值增值与企业竞争力提升的双重目标。