个税补申报需要准备以下手续：个人需携带身份证原件及复印件、收入证明（如工资单或银行流水）、填写完整的纳税申报表，若涉及专项附加扣除还需提供相关证明材料（如子女教育证明、房贷合同等）。企业补报则需营业执照副本、公章、财务报表及原始申报表。线上补报可通过自然人电子税务局或个税APP操作，需登录系统选择对应属期填报数据并完成支付。

补申报手续的设立源于税收征管法的法定要求。根据现行规定，纳税人未按期申报需承担每日万分之五的滞纳金，首次轻微逾期可申请"首违不罚"，但需在税务机关发现前主动补正。材料清单的设计逻辑在于：身份证明用于验证纳税人主体资格，收入证明确保计税依据真实，而专项附加扣除材料则对应税法规定的减免条款。例如住房贷款利息扣除需提供贷款合同编号，赡养老人支出需关联被赡养人身份证信息，这些均需通过原始凭证核验。

线上补报通道的便利性体现征管数字化改革成果。自然人电子税务局已实现历史属期申报功能，系统会自动调取预填数据，但纳税人需手动修正差异项。若发现原申报数据错误，需通过"更正申报"模块重新计算税款，这与《税收征管操作规范》中"错误更正优先于补充申报"的原则一致。值得注意的是，2023年度汇算补税截止日为2024年6月30日，但2025年仍可对往期申报进行更正，这种追溯机制保障了纳税人权益。

对于企业代扣代缴补报，流程更为严格。除基础材料外，需由税管员在金三系统录入补报信息，再至大厅窗口办理。这种双重审核机制源于《个人所得税代扣代缴管理办法》第九条，要求扣缴义务人对补报数据负举证责任。若涉及跨境人员薪酬，还需提供出入境记录和税收居民身份证明，这与CRS国际税务协作要求相衔接。

材料准备的注意事项包括：银行流水需加盖网点章，专项附加扣除证明需注明有效期，境外材料需公证翻译。这些细节要求源于《税收征管法实施细则》第三十四条关于证据效力的规定。实务中常见问题如：个体户经营者误用生产经营所得申报表补报综合所得，或纳税人重复填报子女教育扣除，均会导致申报失败。因此建议补报前通过12366热线或电子税务局"智能咨询"功能预审材料。

滞纳金计算体现税收公平原则。根据测算，补税10万元逾期30天将产生1500元滞纳金，这促使纳税人及时履行义务。但《税务行政处罚裁量基准》规定，因税务机关责任或自然灾害导致的逾期可免除处罚，该条款在2023年郑州暴雨灾害期间曾批量适用。纳税人完成补报后，应通过"申报查询"模块下载回执，这份电子凭证在税务稽查时具有与纸质完税证明同等效力。