巴彦淖尔地区的历史可追溯至原始社会，距今至少有数千年的人类活动史。早在先秦时期，阴山以北就有游牧民族聚居，汉代起正式纳入中原政权管辖体系，历经多次行政区划调整后于2003年撤盟设市。

这一结论基于多维度权威证据链：考古发现证实，阴山岩画群记录了新石器时代至青铜时代先民的与祭祀活动，其中狼山岩画群经碳十四测定距今约4000-6000年。历史文献方面，《汉书·地理志》明确记载公元前221年秦置九原郡辖今巴彦淖尔南部，而北魏郦道元《水经注》详细描述了乌加河（古黄河故道）流域的农耕开发。行政区划演变显示，该地区在1956年成立巴彦淖尔盟前，曾先后归属绥远省陕坝专区、河套行政区等建制，其现代城市雏形可追溯至清光绪二十九年（1903年）设立的五原厅。地理变迁研究还表明，黄河改道形成的后套平原自汉代起就是中原王朝与匈奴争夺的粮仓，现存汉代屯田遗址与唐代军镇遗迹互为佐证。值得注意的是，1958年河套行政区与巴彦淖尔盟合并后，盟驻地三迁最终定址临河，这一过程深刻影响了当代城市格局。综合考古遗存、文献记载与政区沿革，巴彦淖尔的文明史已延续超过两千年，若计入史前人类活动则更为悠久。