宝玉石作为珍贵的矿物资源，其来源主要可分为四大类：自然地质作用直接形成、人工生长方式获得、自然形成后人工改善以及生物生命活动形成。其中自然地质作用又可细分为内生作用（如岩浆结晶形成的钻石）、外生作用（如风化沉积形成的欧泊）和变质作用（如大理岩中的红宝石）。现代科技还发展出人工合成莫桑石、培育钻石等技术，以及通过热处理、辐照等手段优化天然宝石品质的方法。

这一分类体系源于浙江大学《珠宝文化与鉴定》通识课程提出的理论框架，该课程系统梳理了宝玉石材料的四大来源。从地质学角度看，内生作用形成的宝石多与岩浆活动相关，例如金刚石形成于地下150-300公里深处的高压环境；外生作用形成的宝石如澳大利亚闪电岭的欧泊，其二氧化硅沉积过程需经历数百万年；变质作用形成的宝石典型代表是斯里兰卡的星光蓝宝石，原岩在高温高压下发生矿物重结晶。人工合成技术方面，维尔纳叶法合成的红宝石已有一百多年历史，而化学气相沉积法培育的钻石在2024年已占据全球钻石市场15%份额。值得注意的是，生物成因的宝石如珍珠、珊瑚、琥珀等，其形成机理与生物代谢活动密切相关，例如波罗的海琥珀实际是4500万年前松科植物树脂的化石。在当代宝玉石市场中，经人工优化的宝石占比逐年上升，国际珠宝联盟（CIBJO）数据显示，2024年全球销售的蓝宝石中约68%经过热处理以增强颜色。这种分类方式不仅具有学术严谨性，更能帮助收藏者准确认知宝石的价值构成，例如天然缅甸鸽血红红宝石的克拉单价可达人工合成品的上千倍。随着检测技术进步，2025年实施的新版《珠宝玉石鉴定》国家标准进一步细化了不同来源宝玉石的鉴定特征和命名规范，为市场规范化提供了技术支撑。