孔雀鱼幼鱼刚出生时体长仅约0.5厘米，形似透明的小红点或微黄色颗粒。初期身体呈半透明状，尾部短小无明显色彩，腹部可见卵黄囊。随着成长，1-2周后开始显现基础体色，2个月左右性征分化：雄鱼腹鳍逐渐变长并向生殖器发育，雌鱼则保持扇形腹鳍并出现黑色胎斑。健康的幼鱼游动敏捷，身体舒展无畸形，7个月后可达成鱼体型。

幼鱼的外形特征与生理发育具有明确的生物学依据。刚孵化的孔雀鱼幼体仅0.5厘米，这种微小体型是卵胎生鱼类的典型特征，母体直接产出活体幼鱼而非产卵。幼鱼初期体色透明是为适应自然环境中的隐蔽需求，随着发育，其体表色素细胞在2-3周后开始活跃，这与甲状腺激素分泌周期直接相关。研究显示，水质pH值稳定在6.5-7.5、水温维持在22-24℃时，幼鱼变色速度会提升30%。孔雀鱼幼鱼的性别分化在60日龄时显著显现：雄鱼尾鳍面积增大至体长的1/3，背鳍延长呈流线型；雌鱼则因体内卵泡发育导致腹部膨大，上方出现深色胎斑。这种二态性差异源于性染色体上的色素调控基因，其中SRY基因激活使雄鱼产生虹彩细胞，而雌鱼W染色体抑制了多数显色基因表达。幼鱼成长过程中，营养摄入直接影响体型发育。投喂丰年虾幼虫的幼鱼，其体长增速比仅喂食人工饲料的群体快40%，因甲壳动物提供的虾青素能促进骨骼生长。值得注意的是，约15%的幼鱼会出现"针尾症"，即尾部无法正常展开，这通常与水中亚硝酸盐超标或近亲繁殖有关。专业养殖建议采用30升以上水体，保持每周换水1/3，并使用水榕等水生植物为幼鱼提供躲避空间，可降低同类互食率至5%以下。