防城港作为广西重要港口城市，拥有完善的物流体系，主要物流企业包括防城港市港龙物流有限公司、防城港市金海岸物流有限公司、防城港和顺物流有限公司、防城港广宇物流有限公司等综合性物流服务商；汇通物流(防城港)有限公司等专业化工仓储企业；广西防城港金桥国际物流有限公司等国际货运代理企业；防城港北港物流有限公司等具备危化品运输资质的国企；以及防城港融丰航运有限公司、广西信华航运有限公司等航运企业。

防城港物流业的蓬勃发展得益于其独特的区位优势和港口基础设施。2024年防城港完成港口货物吞吐量1.85亿吨，集装箱吞吐量首次突破百万标箱达100.5万标箱，同比增长7.82%。港口区现有18家民营企业入选2024年全市30强榜单，工业对经济增长贡献率高达78.4%。在专业化工物流领域，汇通物流(防城港)有限公司拥有西南地区最大石油化工品仓储中转基地，总库容达100万立方米，2023年危化品铁路专用线投入运营后进一步提升了多式联运能力。国际物流方面，防城港保税物流中心(B型)2024年进出口货运量98.92万吨，总值143.16亿元，在全国84家保税物流中心中排名第4位，其中进境铜精矿"保税混矿"业务量值连续多年居全国首位。现代冷链物流建设也取得突破，北部湾国际生鲜冷链园区已入驻企业近百家，正筹划开通中国防城港至柬埔寨的冷链直航航线。从运输方式看，除传统海运外，防城港物流企业普遍提供陆运、铁运等多式联运服务，2024年全国主要港口集装箱铁水联运量同比增长16.5%的背景下，防城港北港物流有限公司投资4.3亿元建设的西部陆海新通道联运中心项目预计2026年交付后将实现年中转能力750万吨。这些数据充分印证了防城港物流企业集群的规模实力和服务能级，使其成为连接中国-东盟的重要物流枢纽。