邮区中心局作为邮政网络的核心节点，其部门设置通常采用"1+6+6+1"结构模式，即1个生产指挥调度中心、6个通信生产局和6个服务保障部室加1个行政事务管理中心。具体包括邮件处理局、邮件转运局、邮件运输局、航空邮件转运局、邮件容器调拨局、运行维护局等生产部门，以及人事教育部、计划财务部、资产经营部、党委工作部、工会、办公室等职能部门。

这一组织架构的科学性体现在三个方面：生产部门设置遵循邮件处理全流程需求，如西安邮区中心局作为全国七个一级中心局之一，下设的邮件处理局负责分拣封发，转运局承担接发经转，运输局管理干线邮路，形成完整的作业链条。职能部门配置参考了国有企业管理规范，如杭州邮区中心局的资产经营部负责千万元级外包项目监管，计划财务部统筹3.12亿元年营收的财务管理。三级网络体系要求不同层级中心局保持架构统一性，济南邮区中心局与上海邮区中心局虽分属不同省份，但均设有标准化的运行维护局和容器调拨局，确保全国邮政网络协同运作。这种架构设计既满足《邮区中心局体制》要求的"处理、封发、运输"核心职能，又通过生产指挥调度中心的集中管控，实现全国干线网、省内网和邮区网的高效衔接。当前全国86个邮区中心局中，一级局日均处理信函超60万件，二级局汽车邮路总长逾2万公里，三级局年营收普遍突破亿元，证明该部门设置具有业务承载力和管理有效性。