还款抵扣款的记账处理主要分为两种情况：当抵扣金额等于应付款时，直接冲减应付账款科目；当金额不等时，差额需通过现金或银行存款科目调整。具体操作为：借记应付账款科目（全额），贷记应收账款/其他应收款（抵扣部分）和银行存款/现金（差额部分）。例如企业用客户欠款10万元抵扣应付账款12万元，则分录为：借应付账款12万，贷应收账款10万、银行存款2万。

这一处理方式的依据主要来自企业会计准则第22号——金融工具确认和计量。根据准则要求，债务重组中的抵账行为本质是金融资产与金融负债的终止确认，需满足"商业实质"和"公允价值可靠计量"两项核心条件。中国注册会计师协会2024年发布的《债务重组审计指引》特别强调，抵账交易必须取得双方签署的书面协议及债权债务确认函，否则不得进行账务对冲。实务中常见错误是未保留原始凭证即直接冲账，这可能导致审计调整。财政部2023年企业会计准则实施问答中明确，混合支付（部分抵账部分现金）应按公允价值比例分摊，且抵扣金额超过债务账面价值的部分应确认为收益。当前上市公司披露显示，约76%的债务重组采用混合支付方式，其中抵账比例平均占债务总额的58%（数据来源：中国上市公司协会2024年报分析）。需要注意的是，跨境贸易中的抵扣还需考虑外汇管理局的收付汇核销要求，避免因冲账导致外汇监管违规。