纳税主体作为增值税纳税人，其核心义务是按照应税销售额计算销项税额，同时允许抵扣符合条件的进项税额。根据中国现行增值税法规，一般纳税人采用"销项税额-进项税额=应纳税额"的计算方法，小规模纳税人则适用简易计税办法。这种制度设计既体现了税收中性原则，又能有效避免重复征税。

增值税抵扣机制是我国流转税体系的核心制度。根据财政部、国家税务总局联合发布的《关于深化增值税改革有关政策的公告》（2019年第39号），自2019年4月1日起，制造业等行业增值税税率由16%降至13%，交通运输业等行业税率由10%降至9%。这种税率调整直接影响纳税主体的税负水平。统计数据显示，2023年全国增值税收入达6.2万亿元，占税收总收入比重约35%，其中通过进项抵扣机制减轻企业负担约3.8万亿元。国家税务总局2024年发布的《增值税风险管理指引》明确指出，纳税人取得的增值税专用发票必须符合"真实性、合法性、关联性"三性原则方可抵扣。具体而言，发票记载的交易内容必须真实发生，开票方与受票方存在实际业务往来，且交易项目属于增值税应税范围。实务中常见的问题包括：农产品收购发票虚开、虚假运输发票抵扣、跨期发票违规认证等。根据《增值税暂行条例》第八条规定，准予从销项税额中抵扣的进项税额包括：从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额；从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额；购进农产品按照农产品收购发票或者销售发票上注明的买价和扣除率计算的进项税额。特别需要注意的是，用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或个人消费的购进货物、劳务、服务等，其进项税额不得抵扣。2024年实施的"全电发票"改革进一步强化了抵扣管理，通过全国统一的电子发票服务平台实现发票开具、传输、查验的全流程数字化监管。中国税务学会的研究报告显示，增值税抵扣制度的完善使制造业企业平均税负下降2.3个百分点，对促进实体经济发展起到了积极作用。纳税主体应当建立健全增值税管理制度，重点做好进项发票的审核、认证和台账管理，确保抵扣行为的合法合规。