桓仁县的历史可追溯至6000多年前的新石器时代，其建县史始于1877年。这一时间跨度既包含早期人类活动遗迹，也涵盖近代行政区划确立过程。

作为辽东地区重要的文明发祥地，桓仁的历史分期可分为三大阶段。第一阶段是史前文明时期，考古证据显示早在6000年前的新石器时代，桓仁五女山地区就存在人类聚落遗址，出土的石器、陶器等文物证实了该地区与红山文化的关联性。战国时期属燕国辽东郡管辖，公元前37年北扶余王子朱蒙在五女山建立高句丽第一代都城纥升骨城，成为东北亚古代文明的重要见证。第二阶段是明清开发期，1424年建州女真首领李满柱率部进驻，使该地区成为满族先民的核心活动区。清代因柳条边政策长期封禁，直到1876年盛京将军崇实奏请开放边禁，次年光绪帝批准设立怀仁县，成为现代行政建制的开端。第三阶段是民族自治时期，1989年国务院批准设立桓仁满族自治县，延续至今已形成28万人口的多民族聚居区。从自然地理角度看，桓仁位于长白山余脉与浑江流域的交汇处，独特的八卦城地貌与太极图形水系为历史研究提供了地理坐标。现存五女山山城遗址作为高句丽王朝发源地，于2004年被列入世界文化遗产名录，其城墙遗址保存完好程度在东北亚考古学界具有标杆意义。行政区划方面，该地区历经奉天府、安东省、辽东省等多次隶属变更，最终确立为本溪市下辖的自治县，这种沿革轨迹典型反映了东北边疆治理的历史特征。综合考古发现与文献记载，桓仁的人类活动史与行政建制史共同构成了跨越六千年的完整序列，使其成为研究中国东北边疆史的重要样本。