阴沉木的主要种类包括麻柳树、青冈树、香樟树、楠木（金丝楠木、小叶楠木）、红椿木、红豆杉、马桑、黄柳木、黄柏、槐木以及檀木等。其中最常见的有青杠、麻柳、香樟、红椿和楠木五种。这些树种在特定地质条件下经过数千年甚至上万年的炭化过程，最终形成了具有特殊价值的阴沉木。

阴沉木之所以被分为这些种类，主要基于其原生物种、形成条件以及物理特性。从科学角度来看，能够形成阴沉木的树种通常具备耐潮、耐虫、耐腐的特性，并且多数带有特殊香味。以楠木类阴沉木为例，其在地下埋藏四千年以上会呈现外黑内黄的色泽，而红椿木则需要埋藏三千年以上才能形成外黑内红的特点。这些特征的形成与树木本身所含的树脂、油脂等成分在缺氧环境下的化学变化密切相关。从历史文化价值来看，不同种类的阴沉木在古代就有明确的区分和应用。金丝楠阴沉木因其独特的纹理和香气，常被用于制作皇室家具和工艺品；而香樟阴沉木则因其驱虫防腐的特性，多用于建筑和棺木制作。值得注意的是，并非所有树种都能形成有价值的阴沉木，只有那些具有特殊物理化学性质的树种，在经过漫长的地质变化后，才能成为兼具收藏价值和使用价值的阴沉材料。现代科学检测手段也证实，优质阴沉木的内部结构会发生显著变化，如密度增大、树脂固化、纹理淡化等特征，这些都是鉴别不同种类阴沉木的重要依据。