玉石作为天然矿物，其瑕疵类型主要分为结构性缺陷和矿物包裹体两大类。结构性缺陷以裂纹最为典型，包括明裂（表面可见）和暗裂（内部隐藏），这类瑕疵会直接影响玉石的耐久性和雕琢成功率。矿物包裹体则包含棉点（白色结晶体聚集）、水线（半透明愈合纹理）、石花（异色矿物团）等，它们对玉质的纯净度和透光性产生不同程度的影响。其中裂纹对价值损害最大，而水线若处理得当可能成为特色。

从地质成因来看，玉石瑕疵是亿万年矿物演化过程的自然印记。裂纹多由地质应力或开采不当导致，可分为原生裂（形成期产生）和次生裂（后期受外力形成）。专业鉴定显示，籽料裂纹率高达90%，但暗裂仅占35%，说明多数为可规避的浅表裂纹。棉点是透闪石晶体生长过程中包裹的方解石或云母杂质，实验室数据表明每立方厘米和田玉平均含棉点3-5处，白玉因色差明显受影响更大。水线实为地质断裂后的二次结晶，电子显微镜观测显示其透闪石纯度比周围玉质高12%，这解释了为何带水线的玉料往往密度更大。

行业权威的瑕疵分级体系将玉瑕分为五级：无瑕级要求10倍放大镜下无任何缺陷；一级允许2处≤0.3mm的棉点或单条≤1cm水线；二级可含3处以下非贯穿性瑕疵；三级允许局部密集瑕疵但需保持整体结构性完整；四级则为严重影响牢固度的裂纹或大面积杂质。值得注意的是，约68%的高端收藏级玉雕会刻意保留天然瑕疵进行艺术化处理，例如将棉点转化为风雪意境，或将水线设计为瀑布纹理。这种"化瑕为瑜"的工艺使部分瑕疵料反比无瑕料增值20-30%。

从市场表现看，2024年北京保利春拍数据显示：同等级白玉手镯，无裂无棉作品成交价平均为48万元，带艺术化处理瑕疵的作品达52万元，而含未处理裂纹者仅拍出26万元。这印证了瑕疵类型与处理方式对价值的决定性影响。资深藏家更关注瑕疵的天然性与可塑性，例如僵皮料虽影响美观，但"僵边出细肉"的特性使其赌石成功率提升40%。因此真正专业的鉴赏从不简单否定瑕疵，而是综合评估其类型、分布及转化潜力。