新生小猫死亡的主要原因包括先天异常、生产创伤、溶血症状、营养不良及母猫护理不当等。其中先天异常如心脏缺陷、骨骼发育不全等遗传性疾病是导致出生即死亡的首要因素，而母猫初次生产时缺乏经验或产后状态异常也会显著提高幼崽死亡率。

从遗传学角度看，纯种猫近亲繁殖会大幅增加基因缺陷概率，例如英国短毛猫、苏格兰折耳猫等品种因血型多样性（A型与B型共存），若交配双方血型不匹配，幼崽吸食初乳后可能发生溶血反应致死。数据显示未进行血型筛查的繁育案例中，因溶血导致的新生猫死亡率可达20%。母猫怀孕期间若感染猫瘟病毒或服用禁忌药物，胎儿器官发育会受严重影响，约15%的流产案例与母体病毒感染直接相关。在生产环节，难产导致的窒息占死亡原因的12%，尤其是头胎母猫因产道狭窄易造成幼崽挤压伤。环境因素也不容忽视，当产房温度低于26℃时，新生猫因体温调节功能未完善，低体温症致死率上升至30%。母猫产后护理能力差异同样关键，初产母猫中约8%会出现拒绝哺乳或压死幼崽的行为，这与激素分泌异常有关。值得注意的是，一窝超过4只的幼崽因母乳分配不足，其成活率比1-3只的窝次降低40%，这验证了"质优于量"的繁育规律。专业机构建议，科学繁育需提前进行母猫基因检测、血型配对及营养评估，分娩时保持29-32℃恒温环境，产后72小时内每小时监控幼崽体重变化，这些措施可将新生猫存活率提升至85%以上。