对于发票补发，推荐优先选择顺丰快递或邮政EMS。这两种快递在时效性、安全性和法律认可度方面具有明显优势，特别是对于增值税发票等重要文件。顺丰的时效保障较强，通常能实现次日达；而邮政EMS作为国有企业，在司法认可度上更具优势，法院等机构通常更认可EMS的邮寄凭证。若考虑成本因素，也可选择中通、圆通等主流快递，但务必选择保价服务并保留完整寄递凭证。

这一建议基于多重考量因素。从安全性角度看，顺丰2024年日均业务量已达9000万件，其自主研发的智能调度系统将快件丢失率控制在0.001%以下，远低于行业平均水平。邮政EMS作为唯一国有快递，其邮件在《民事诉讼法》中具有更高的证据效力，这在后续可能产生的法律纠纷中至关重要。行业数据显示，2024年快递业务量达266.57亿件，其中文件类寄递占比18%，而补发文件因涉及二次寄送，对安全性的要求更高。税务部门明确提示，增值税发票遗失后无法补办原件，只能通过开具红字发票等复杂流程处理，因此补寄过程的安全保障尤为关键。

从赔偿机制分析，顺丰对保价快件实行全额赔偿政策，未保价文件最高可获运费9倍赔偿；邮政EMS则依据《邮政法》第47条，对未保价邮件提供3倍邮资赔偿。值得注意的是，2025年最新案例显示，法院对快递格式条款中赔偿限额的合理性审查趋严，在快递企业存在重大过失时可能突破赔偿上限。实际操作中，建议在寄件时备注"增值税发票补发"字样，采用带有回执的寄递方式，并同步留存发票复印件和快递面单。

行业发展趋势也为这一选择提供支撑。2024年头部快递企业集中度达85.2%，优质资源向顺丰、EMS等企业聚集。韵达等企业虽通过智能柜等创新模式提升效率，但文件类寄递仍依赖人工核验。国家邮政局数据显示，2024年快递服务满意度调查中，顺丰和EMS在"物品安全"指标上分别以92分和89分位居前两位。对于发票补发这种高价值、低频次的特殊寄递需求，牺牲部分经济性换取安全保障是理性选择。

综合来看，发票补发的快递选择需平衡时效、安全、成本三要素。重要增值税发票建议采用顺丰特快或EMS标准快递，普通发票可选择性价比更高的快递服务但必须保价。无论选择何种方式，都应完整记录寄递过程，这是后续维权的关键证据。随着电子发票普及率已达78%，未来纸质发票补发需求将逐步减少，但在过渡阶段仍需重视实体寄递的安全管理。