军人公积金主要由部队内部的住房公积金管理中心负责管理。现役军官的公积金缴存、提取等业务需在所属部队的公积金管理中心办理，义务兵则不享受公积金待遇。军人退役后，若选择就业，则由新单位在地方住房公积金管理中心办理缴存；若未就业，可按灵活就业人员政策自愿缴存。

这一管理机制的确立主要基于两方面政策框架：一是部队系统的特殊性要求。根据相关规定，现役军人的公积金实行封闭式管理，由军队后勤部门设立的住房公积金管理中心统一负责，与地方系统完全独立。这种管理模式既能保障军事信息安全，又能针对军人职业特点制定差异化政策，例如军官公积金在退伍时可一次性提取。二是与地方政策的衔接性规定。退役军人事务部联合多部门明确要求，军人退役后公积金账户可无缝转移至地方，转入金额在申请贷款时可合并计算缴费年限。各地公积金管理中心需为退役军人开设绿色通道，例如怒江州允许灵活就业的退役军人按最低缴存基数（当地社平工资的60%）自愿缴存，并享受与在职职工同等的贷款权益。

从数据层面看，2025年新修订的《西安市住房公积金缴存实施细则》首次将军队文职人员纳入强制缴存范围，要求用人单位按5%-12%的比例足额缴存。而沈阳等城市公布的办事指南显示，退役军人办理公积金转移时只需提供部队出具的缴存证明，最快1个工作日即可完成账户合并。值得注意的是，部分经济发达地区如大连已将退役军人公积金贷款额度上浮20%，但缴存基数上限仍统一按29949元执行（2024-2025年度标准）。这些政策既体现了对军人贡献的补偿机制，也遵循了《住房公积金管理条例》第十三条关于"专户管理、权责分明"的基本立法精神。

当前公积金制度改革趋势下，军人住房保障体系呈现三个新特征：一是数字化程度提升，现役军人可通过军队内部政务平台查询缴存明细；二是待遇梯度更加细化，服役满10年的军官贷款额度可达60万元；三是跨域办理更便捷，海南等省已试点异地公积金贷款"带押转贷"业务。这些变化共同构成了军人公积金管理的现代化图景。