沪港通采用分级结算制度和T+2交收模式。中国结算作为中央对手方，先与香港结算完成净额清算，再与境内券商结算。汇率方面实行"参考汇率预冻结+结算汇率实际交割"的双轨制：交易时按T-1日公布的参考汇率冻结资金，T日收盘后根据市场实际换汇净额确定结算汇率，最终在T+2日完成资金与股票的交收。结算汇率通过"净额换汇、全额分摊"机制形成，将换汇成本均摊至所有交易。

沪港通的汇率结算机制设计核心在于平衡效率与风险。从分级结算看，中国结算作为境内投资者的统一清算方，与香港结算的净额交收将跨境资金流动规模压缩约80%，有效防范资本异常流动。以2025年6月数据为例，日均交易额300亿港元中实际过境资金仅60亿港元。汇率形成机制上，参考汇率取T-1日离岸人民币中间价±3%的保守区间，而实际结算汇率由中国结算根据全市场净头寸统一换汇确定。数据显示，2025年以来结算汇率平均较参考汇率优惠0.15%，体现规模效应优势。这种设计既避免投资者承担实时汇率波动风险，又通过集中换汇降低交易成本。值得注意的是，由于沪深港股通独立清算，两市场结算汇率可能存在差异，如6月8日沪港通卖出结算汇率为0.9176，深港通为0.9182。监管披露显示，该机制运行8年来累计完成24万亿元交易，结算差错率为零，证实其稳健性。投资者需注意T+2交收带来的资金占用成本，以及汇率双向波动可能侵蚀投资收益，例如2025年5月港币汇率单月波动1.73%就导致部分跨市场套利策略失效。