对于年收入100万元的餐饮个体工商户，其税费主要包括增值税和个人所得税两部分。若为小规模纳税人，增值税按1%征收率计算约为1万元；个人所得税若采用查账征收方式，假设扣除成本后应纳税所得额为50万元，适用30%税率并减半征收后约为10.95万元。综合税负约11.95万元。若符合核定征收条件，部分园区可享受更低税率甚至免税。

餐饮个体工商户的税费计算需结合经营模式、征收方式及政策优惠综合判定。增值税方面，现行政策规定小规模纳税人适用3%征收率的应税销售收入减按1%征收，月销售额10万元以下还可免征。对于年收入100万元的餐饮业主，若按月均摊则符合免税条件，但若单月超10万元则需按1%缴纳，即约1万元。个人所得税的计算更为复杂，主要分为查账征收与核定征收两种方式。查账征收需以收入总额减除成本、费用及损失后的余额为应纳税所得额，适用5%-35%超额累进税率。假设扣除食材、人工、租金等成本后利润率为50%，则50万元应纳税所得额按30%税率计算应缴14.25万元，但当前政策对不超过100万元部分减半征收，实际税负约7.125万元。若采用核定征收，部分地区对餐饮业按0.5%-1.5%的综合征收率计税，税负可降至0.5万-1.5万元。附加税按增值税的12%计算，若增值税免税则同步减免。值得注意的是，2025年个人所得税法对经营所得维持5%-35%税率结构，但针对小微主体的税收优惠持续加码，如应纳税所得额100万元以内的减半政策延续至2027年。实务中还需考虑区域性差异，例如海南自由贸易港对餐饮业有额外15%税率上限的优惠，而部分县域经济开发区则提供"三免三减半"政策。餐饮业主应结合自身账簿健全程度、成本占比及地方政策选择最优纳税方案，必要时可通过分拆经营主体、合理利用税收洼地等方式实现税负优化。税务机关也建议纳税人通过电子税务局申报，系统将自动计算可享受的减免税额。