进项税认证金额的计算公式为：可抵扣进项税额=增值税专用发票上注明的税额+海关进口增值税专用缴款书注明的税额+农产品收购发票或销售发票注明的买价×扣除率+通行费电子普通发票注明的税额。纳税人需在增值税发票综合服务平台勾选确认，并在申报期内通过《增值税及附加税费申报表附列资料（二）》填报数据。

根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条及国家税务总局公告2019年第45号文件规定，增值税一般纳税人当期进项税额的抵扣需满足"合法有效凭证、用途符合规定、认证时限合规"三大要件。合法凭证包括增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票等六类票据，其中专用发票需通过国家税务总局全国增值税发票查验平台验证真伪。2023年增值税改革后，农产品扣除率调整为9%（深加工企业可加计1%），通行费电子普通发票按征税发票注明税额抵扣。认证时效方面，2017年7月1日起取消360日认证期限限制，改为"当期申报抵扣"制度，但纳税人需在开票日期所属月份次月1日至15日的申报期内完成勾选确认。实际操作中，纳税人需登录电子税务局进入"发票勾选平台"，对符合抵扣条件的票据进行用途确认。统计显示，2024年全国企业通过该平台勾选认证的进项税额达12.8万亿元，其中制造业占比62.3%。需特别注意的是，用于集体福利、个人消费、免税项目、简易计税方法计税项目等非生产经营用途的进项税额不得抵扣。若发现已认证票据存在异常凭证，应按国家税务总局公告2019年第38号要求作进项税额转出处理。企业财务人员应建立抵扣台账，完整记录每笔进项税额的认证时间、抵扣情况等信息，以备税务机关查验。