蜂蜜销售开具增值税普通发票时适用9%的税率。若为小规模纳税人，则按照3%征收率开具发票（2025年现行政策）。

蜂蜜作为初级农产品，其增值税政策依据《财政部 国家税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》（财税〔2017〕37号）及后续修订文件。根据我国现行增值税法规体系，农产品增值税政策主要呈现以下特点：一是农业生产者销售自产蜂蜜免征增值税，依据《增值税暂行条例》第十五条第一款规定；二是企业购进蜂蜜再销售适用9%税率，属于《农业产品征税范围注释》中"其他畜牧产品"类别；三是小规模纳税人适用简易计税方法，2025年仍延续3%征收率政策。国家税务总局2023年发布的《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》进一步明确，蜂蜜加工企业可申请核定扣除进项税额。实践中需注意区分不同环节：蜂农直销免税，流通环节一般纳税人开9%专票，小规模纳税人开3%普票。跨境贸易方面，蜂蜜出口适用零税率，而进口蜂蜜按13%征税（最惠国税率）。特殊情况下，如扶贫采购或农业产业化联合体内部交易，可能适用地方性税收优惠。政策执行时需结合《增值税发票开具指南》及国家税务总局公告2024年第11号关于农产品抵扣的新规，确保票面品名准确标注为"蜂蜜"而非笼统的"农产品"，同时注明规格等级等信息以符合抵扣要求。