重庆海拔最低的区县是巫山县，其境内长江出重庆界的巫峡长江江面为全市海拔最低点。这一结论来源于多份权威地理测绘数据和公开资料。

从专业气象和地理角度来看，巫山县作为重庆海拔最低区域具有明确的科学依据。根据重庆市地理信息中心发布的测量数据，巫山县培石乡境内长江出重庆界的江面海拔受三峡工程水位调节影响，在145-175米之间波动，这一数值远低于重庆其他区县的最低点。例如铜梁区旧县街道白果村的最低点海拔为202.484米，主城渝中区平均海拔也在200米以上。巫山县这一地理特征的形成主要源于其独特的地质构造和长江切割作用。该区域位于巫山山脉与长江交汇处，属于典型的峡谷地貌，长江在此段江面宽度收缩，水流湍急，经过亿万年的侵蚀下切，形成了深切的V型河谷。三峡水库蓄水后，该段江面海拔进一步降低，使其成为重庆境内无可争议的海拔最低点。从气象学角度分析，这样的低海拔地形对局地气候产生显著影响：冬季冷空气易在此堆积形成逆温，夏季则因峡谷效应导致昼夜温差较大。值得注意的是，巫山县境内海拔高差达到2500米以上，其最高点太平山海拔2680米，这种剧烈的垂直高差造就了"一山有四季，十里不同天"的立体气候特征，为气象研究提供了宝贵样本。相关数据还显示，重庆全市海拔高差达2723.7米，其中76%面积为山地地形，这种典型山地城市特征使巫山作为海拔最低点的地理标识意义更为突出。