当前连云港水质较差的区域主要集中在东海县石英砂酸洗作坊周边、连岛景区海域以及部分入海河流流域。其中东海县房山镇林疃村因石英砂酸洗废水直排问题，导致地下水和地表水受到严重污染；连岛景区海域近年来出现水质恶化现象，表现为海水浑浊、泡沫增多；烧香河、排淡河等入海河流因工业和生活污水排放，水质长期处于不稳定状态。

东海县作为水晶和石英砂矿产主产区，其酸洗工艺产生的含酸废水对水环境造成持续性破坏。当地村民反映，房山镇林疃村周边聚集了60余家石英砂酸洗作坊，这些企业将未经处理的含酸废水直接排放，导致地下水无法饮用，农田灌溉用水也受到污染。监测数据显示，该区域水体pH值严重偏低，重金属含量超标，形成了典型的水质性缺水问题。市虽已将该区域列入环境监管重点单位名录，但治理成效尚未完全显现。

连岛景区作为连云港著名海滨旅游区，其水环境质量波动较大。游客反馈显示，该海域近两年水质明显下降，表现为海水浑浊发黄、泡沫堆积，与往年清澈见底的"玻璃海"形成强烈反差。分析认为，这与周边海域开发活动增加、船舶污染排放以及陆源污染物入海有关。虽然2023年全市近岸海域水质整体达到有监测记录以来最优水平，但局部海域仍存在污染反弹现象，反映出海洋环境治理的复杂性和长期性。

烧香河、排淡河流域的水质问题具有典型代表性。作为入海河流，它们承担着城市排水和农业灌溉双重功能，但沿岸工业废水、生活污水和农业面源污染导致水体富营养化严重。2025年5月的巡查报告指出，这些河流仍需加强排污口溯源整治和生活污水收集处理。监测数据表明，虽然国考断面水质达标率提升至90.9%，但雨季仍会出现水质波动，说明雨污分流和面源污染控制仍需完善。

从治理角度看，连云港已实施多项针对性措施。包括建立环境监管重点单位名录，对污染企业实施动态监控；推进"美丽海湾"建设，整治入海排污口378个；实施近岸海域污染物削减重点工程20个。2024年城市供水水质监测显示，出厂水和管网水合格率均达100%，说明饮用水安全保障体系运行有效。但区域性水质问题仍需通过产业结构调整、污染源系统治理等长效机制逐步解决，这既是环境保护的必然要求，也是实现高质量发展的关键环节。