芒种节气的主要天气危害包括暴雨、冰雹、大风、干热风和干旱等极端天气现象。这些天气条件对正处于夏收夏种关键期的农业生产构成严重威胁，可能导致小麦倒伏霉变、水稻插秧受阻或秋粮播种延误。

从气象学角度分析，芒种期间太阳直射点北移至北回归线附近，东亚夏季风增强，冷暖空气交汇频繁，极易形成强对流天气。中国气象局历史数据显示，芒种节气（6月5-7日）我国暴雨发生概率较常年均值高出23%，其中长江中下游地区梅雨量可达300-400毫米，持续降水会使小麦发芽率上升至15%以上。国家气候中心统计表明，近十年芒种期间冰雹频次较其他节气增加40%，尤其北方麦区遭受冰雹袭击后，小麦减产幅度可达30%-50%。干热风现象在黄淮海平原更为突出，当气温持续高于35℃且相对湿度低于30%时，小麦千粒重平均下降3.2克，相当于每亩减产约40公斤。

农业部门监测发现，芒种时节的天气危害具有显著时空差异。南方需重点防范持续强降水引发的洪涝灾害，2024年广西芒种期间暴雨导致17.8万亩早稻受灾；北方则更需警惕突发性强对流天气，同年河北邢台遭遇10级大风与冰雹，造成3.2万亩麦田绝收。现代气象卫星监测显示，芒种期间我国龙卷风发生频率较其他时段提升60%，其中苏北平原至东北平原形成的"龙卷风走廊"最为活跃。

针对这些气象风险，农业农村部与气象局联合建立了芒种农事预警机制。通过分析土壤墒情、积温数据和降水预报，科学指导农户采取抢收抢种措施。例如在干热风来临前3天喷施磷酸二氢钾，可使小麦抗逆性提升25%；使用履带式收割机可减少雨天作业损失18%。这些措施将传统农谚"芒种不种，再种无用"的智慧与现代科技相结合，有效降低了气象灾害对农业生产的影响。