从三亚市区到分界洲岛的航行时间通常在20-40分钟之间，具体时间取决于出发码头、船只类型以及当天的海况条件。快艇通常需要20-30分钟，而普通轮渡则需要30-40分钟。

作为气象专家，我认为这个时间范围的确定是基于多方面的科学考量。从地理距离来看，分界洲岛距离三亚市区约45公里，按照一般船只20-30节(约37-55公里/小时)的航速计算，理论航行时间应该在30分钟左右。然而实际航行时间会受到多种气象和海洋因素的影响。

海况是影响航行时间的关键变量。在风平浪静的条件下，船只可以保持较高航速，使航行时间接近理论最小值20分钟；而在风力达到4-5级、浪高0.6-1.2米时，船只需要减速以确保安全，航行时间可能延长至40分钟甚至更久。特别是在夏季台风季节，强风和巨浪会显著增加航行时间。

船只类型也是重要因素。高速客船配备更强劲的动力系统，能在较短时间内完成航程，但对海况变化更为敏感；普通客船虽然速度较慢，但稳定性更好，在恶劣天气下仍能保持相对稳定的航行时间。

出发码头位置也会影响总耗时。从三亚湾码头出发的航程较短，而从崖州码头出发则需要更长时间。游客还需考虑从市区到码头的陆路交通时间，这通常需要30-60分钟不等。

从专业角度看，建议游客在规划行程时预留充足的时间缓冲，特别是在5-10月的台风多发季节。可以提前查询当地海洋气象预报，了解实时海况信息。同时选择正规运营公司的船只服务，这些公司通常配备更先进的导航设备和更有经验的船员，能够在保证安全的前提下优化航行时间。