长江流域的垂钓管理工作主要由农业农村部门负责。具体到地方层面，各地农业农村局是垂钓行为的主管部门，同时公安机关、市场监管、生态环境等部门按照职责协同管理。例如武汉市明确规定农业农村部门是长江流域重点水域垂钓管理工作的主管部门，负责监督管理垂钓行为。

这一管理架构的确立具有充分的法律依据和政策背景。从国家层面看，农业农村部作为渔业行政主管部门，早在2020年就出台了《关于加强长江流域禁捕执法管理工作的意见》，明确要求各级渔业主管部门加强执法能力建设。2024年底发布的《关于进一步加强长江流域禁捕水域垂钓管理工作的意见》进一步细化规定，要求沿江各省市农业农村厅（委）切实履行垂钓管理职责。地方层面也相继出台配套法规，如《武汉市长江流域重点水域垂钓管理暂行办法》于2024年12月颁布，明确划分了各部门的管理边界：农业农村部门负责垂钓行为监管，公安机关负责治安管理，市场监管部门查处违规渔具销售，生态环境部门则监管饮用水源保护区。这种"主管部门+协同部门"的模式既确保了管理专业性，又形成了执法合力。

从执法实践来看，这套管理体系成效显著。湖北移动开发的"AI数字哨兵"系统通过定位技术向进入保护区人员发送警示短信，这种技防手段有效支撑了农业农村部门的监管工作。铜陵市农业农村局2025年5月查处的垂钓案件显示，基层农业农村部门确实在履行执法主体职责。特别值得注意的是，一些地区还创新设立了长江综合行政执法大队，如安徽望江县将渔政、采砂、渔船检验等执法职能整合，在禁捕期间以农业农村局管理为主，这种模式既提高了执法效率，也强化了部门协同。

垂钓管理的专业化程度也在持续提升。农业农村部门建立了垂钓备案信息系统，部分地区试行注册发证制度。2024年12月开展的跨年禁捕联合执法行动中，农业农村部会同公安部、市场监管总局实施全链条监管，这反映出主管部门正在构建更完善的监管体系。对于垂钓者而言，了解这些管理规定至关重要，比如在武汉长江段垂钓时，既要遵守"一人一竿一线一钩"的基本要求，也要注意钓获保护动物必须立即放生、外来物种不得随意释放等特殊规定。这些细致的管理措施，正是农业农村部门基于专业判断制定的保护策略。