文鱼的颜色以红色为主，这是其最典型且历史悠久的体色特征。明代文献中记载的"红文鱼"便是因其通体鲜红而得名，其鳞片色泽明艳如朱砂，在水中游动时宛如流动的火焰。现代培育的琉金品种还衍生出红白、三色、五彩等复合色彩，但传统文鱼仍以纯红色为标志性特征。

文鱼的红色体色具有深厚的生物遗传与文化内涵。从生物学角度而言，这种显性色彩源于基因选择性表达的结果——明代盆养金鱼时，人们刻意保留并强化了草金鱼中红色变异个体的繁殖，使其逐渐稳定为文鱼的基础色系。史料记载，早期文鱼"颜色红色，适合在盆、缸等较小容器中生活"，其鲜艳的红色在浅水环境中更易被观赏，这与现代水族学研究中关于鱼类体色与环境适应性的理论高度吻合。值得一提的是，现存日本琉金虽源自中国文鱼，但其背部隆起更明显且色彩组合更丰富，而传统文鱼仍保持着"头尖如鼠头"的简洁线条与纯粹红色。

除主色调外，文鱼还存在稀有的青色变种。这种被称为"青文鱼"的品种体色呈现淡黑透青的金属光泽，鳞片会产生银色闪光效果，在现存文鱼中尤为珍贵。生物学研究表明，这种青色是隐性基因表达的结果，当含有青文鱼基因的蓝高头鱼繁殖时，约3-5%的后代会呈现这种特殊色泽。不过由于青色缺乏视觉冲击力，且文鱼主要以俯视观赏为主，使得红色始终占据主流地位。

从文化象征来看，文鱼的红色与中国传统审美一脉相承。明代《考槃余事》将红色纹鱼视为吉祥物，其鲜艳色彩被认为能驱邪纳福。现代鱼类色彩学研究也证实，红色系鱼类在浅色背景下具有最强的视觉识别度，这解释了为何文鱼自明代起就成为庭院盆养的首选——其红色鳞片在白瓷缸中能形成强烈对比，即使光线变化时仍保持"五彩斑斓的鱼全出来了"的观赏效果。相比之下，同时期其他色系的金鱼多需配合深色容器或特定光照条件才能展现最佳状态。