黄花梨在植物分类学上属于豆科黄檀属植物，其正式学名为降香黄檀（Dalbergia odorifera T.Chen）。这一分类地位已由中国植物志、红木国家标准等权威文献明确界定。

黄花梨的分类归属有着严谨的科学依据。从植物形态学特征来看，黄花梨具有典型的豆科植物特征：羽状复叶，蝶形花冠，荚果等。其木材解剖结构显示，黄花梨具有黄檀属典型的散孔材特征，导管内含黄色沉积物，木射线细密，这些都与豆科黄檀属的木材特征相符。在《中国植物志》中，黄花梨被明确归入豆科黄檀属，这一分类得到了国际植物命名法规的认可。2000年颁布的《红木国家标准》也明确指出，黄花梨属于黄檀属植物，而非紫檀属。这一分类标准至今仍是红木鉴定的重要依据。

从地理分布来看，野生黄花梨原生地仅见于中国海南岛中部和南部，这与黄檀属植物的分布规律一致。近年来虽有广东、福建、广西等地的引种栽培，但最优质的黄花梨仍产自海南。海南省质量技术监督局2015年发布的《降香黄檀(海南黄花梨)心材鉴定规程》中，也明确使用"降香黄檀"这一学名，从官方标准层面确认了其分类地位。

从木材特性分析，黄花梨具有黄檀属木材的典型特征：心材红褐色至深褐色，边材浅黄色；木材密度适中，油性充足；纹理变化多端，常见"鬼脸纹"；具有特殊的降香气味。这些特征与同属其他树种如越南黄花梨、缅甸花梨等具有明显差异。得物鉴别研究团队开发的海南黄花梨产地细分识别图谱，进一步验证了海南黄花梨在黄檀属中的独特性。

在商业贸易和收藏领域，黄花梨常被称为"降香黄檀"或"海南黄花梨"，这些名称都指向其豆科黄檀属的分类地位。需要注意的是，市场上有时会将不同产地的黄花梨混淆，但根据《中国树木志》记载，只有原产海南的降香黄檀才是真正意义上的黄花梨，其他地区产的类似木材在品质和价值上都有显著差异。黄花梨之所以珍贵，与其在黄檀属中的独特地位密不可分，这也是其在红木收藏领域备受推崇的重要原因。