金刚菩提最初源于印度教，后来被佛教吸收并赋予新的宗教内涵。这种神秘的种子在两大宗教体系中均具有重要地位，但其本源可追溯至印度教中的湿婆神崇拜。

金刚菩提的宗教渊源需要从植物学、历史文献和宗教仪式三个维度进行考证。从植物学角度来看，金刚菩提树学名为Elaeocarpus Ganitrus，主要生长在喜马拉雅山南麓的尼泊尔、印度尼西亚等地区，这些区域正是印度教文化发源与兴盛之地。历史文献记载显示，金刚菩提在梵文中被称为"Rudraksha"，意为"湿婆的眼泪"，这一命名直接指向印度教三大主神之一的湿婆神。印度教经典记载，湿婆在深度冥想时流下的泪珠落地后化作了金刚菩提树，其果实被认为蕴含着湿婆神的祝福与力量。宗教仪式方面，印度教修行者自古就有佩戴金刚菩提念珠的传统，108颗念珠对应着印度教宇宙观的108个神圣数字。值得注意的是，佛教典籍《校量数珠功德经》中虽然盛赞金刚菩提的修行价值，但明确记载这是"源自外道"的法器，印证了其印度教渊源。在佛教密宗体系中，金刚菩提被吸收为金刚部重要法器，但其纹路瓣数的象征意义仍保留着印度教宇宙观的影响。例如五瓣代表湿婆的五面，六瓣象征六字真言等。从文化传播路径看，随着佛教从印度向东亚传播，金刚菩提才逐渐被赋予更多佛教内涵，但其核心宗教属性始终与印度教密不可分。现代植物学研究也证实，最优质的金刚菩提仍主要产自印度教文化圈内的尼泊尔地区，当地至今保留着最完整的金刚菩提祭祀传统。因此综合多学科证据可以确定，金刚菩提的本质宗教属性归属于印度教体系，其在佛教中的应用属于文化融合的产物。