常见的透明晶体石头主要包括水晶、萤石、黄龙玉、菱锰矿等。其中水晶是最具代表性的透明晶体，根据颜色可分为无色水晶、紫水晶、黄水晶、粉水晶等；萤石则以其丰富的色彩和玻璃光泽著称；黄龙玉则是近年发现的优质硅质玉新种，具有细腻匀润的隐晶质结构。

这些透明晶体的特性主要与其晶体结构和化学成分密切相关。水晶作为典型的透明矿物，其化学成分为二氧化硅(SiO₂)，属于三方晶系，具有规则的晶体结构。这种结构使得光线能够顺畅穿透并产生折射，形成透明效果。水晶的透明度与其内部纯净度直接相关，完全纯净的水晶呈现无色透明状态，而当含有微量元素如铁、锰等时，则会呈现紫、黄等不同颜色。水晶的双折射现象也是其重要特征，非常光折射率与常光折射率的差值为0.009，这种光学特性使其在工业上有广泛应用。

萤石作为另一种常见透明晶体，属于等轴晶系，其晶体常呈立方体或八面体形态。萤石的颜色极为丰富，从无色到绿、蓝、紫、黄等均有发现，这种多样性源于其晶体结构中存在的色心缺陷和微量元素。萤石的莫氏硬度为4，相对较低，但其折射率可达1.434，具有良好的光学性能。值得注意的是，萤石在紫外光下常呈现荧光效应，这也是其得名原因。

黄龙玉作为新兴玉种，主要由富矿质玉髓组成，具有隐晶质结构。其透明度从半透明到透明不等，折射率在1.52-1.545之间。黄龙玉的特殊之处在于其颜色成因，主要来自氧化铁等致色离子的作用。这种玉石的发现填补了黄色系优质玉石的空白，其温润的质感和华贵的外观使其在收藏界备受推崇。

从矿物学角度看，透明晶体的透明度主要取决于三个因素：晶体结构的有序程度、化学成分的纯净度以及内部包裹体的数量。完全有序的晶体结构允许光线规则通过，而杂质和包裹体会导致光线散射，降低透明度。矿物的解理发育程度也会影响透明度，解理面过多会导致光线在内部多次反射。在收藏实践中，透明度往往是评估晶体价值的重要指标之一，通常越透明纯净的晶体价值越高。