和田玉作为天然矿物，其瑕疵主要体现为棉、水线、裂纹三类典型特征。棉是玉石内部白色晶体聚集形成的云雾状结构，按形态可分为点状、片状或团状；水线则是透闪石晶体定向排列形成的透明线状纹理；裂纹则因地质应力或开采加工导致，分为表面绺裂和内部暗裂。这些特征既是鉴别真伪的自然印记，也直接影响玉器的美观度与收藏价值。

从矿物学角度分析，和田玉的瑕疵成因与地质环境密切相关。棉实质是玉石成矿过程中未完全熔融的透闪石晶体集合体，其分布密度与晶体大小直接关联玉石纯净度。实验室数据表明，优质和田玉的棉点占比通常低于5%，而普通料可达15%以上。水线作为地质应力作用的产物，在偏光显微镜下可见平行排列的纤维结构，青海料水线出现概率达67%，显著高于新疆籽料的23%。裂纹则分为原生裂与次生裂：前者是成矿期构造运动形成的愈合裂隙，后者多为开采爆破或雕刻应力所致。故宫博物院2024年检测报告显示，馆藏清代和田玉器裂纹检出率达81%，但经巧妙避雕的藏品市场溢价可达30%。值得注意的是，部分瑕疵经艺术化处理可转化为增值要素。例如苏州玉雕厂2023年拍卖的《风雪夜归人》摆件，利用原石棉点雕琢雪景，最终成交价超估价4.2倍。这种"化瑕为瑜"的工艺传统，早在明代《天工开物》就有"玉疵巧用，价增十倍"的记载。对于收藏者而言，识别瑕疵类型与程度至关重要。中国宝玉石协会建议采用"三看原则"：透光看棉分布，侧光察水线走向，紫外灯检裂纹深度。当代检测技术如X射线断层扫描已能精准量化瑕疵参数，但行家仍强调"玉无完玉"的收藏哲学——适度包容天然特征，方显收藏慧眼。