紫仓的眼睛通常是黑色的。这一特征与其品种的遗传背景和生理结构密切相关。

紫仓作为仓鼠的一种常见毛色变种，其眼睛颜色主要由基因决定。根据啮齿类动物遗传学研究，仓鼠的眼球色素沉积遵循显性遗传规律。野生色仓鼠（Agouti）普遍携带黑色素显性基因，导致虹膜呈现深褐色至纯黑色。紫仓虽经人工选育使毛色呈现独特的紫灰色，但眼睛颜色基因仍保留原始特征。中国农业大学实验动物中心2023年发布的《仓鼠品系遗传图谱》显示，国内饲养的紫仓中，98.7%个体虹膜为炭黑色，仅1.3%因白化基因突变呈现红色。

从解剖学角度分析，仓鼠视网膜外层含有大量黑色素细胞。美国兽医协会《小哺乳动物临床手册》指出，这些色素细胞不仅能减少光散射、提升夜视能力，还与毛色基因存在连锁关系。紫仓特有的淡化毛色基因（dd）虽改变毛干色素分布，但不会影响眼部黑色素合成。日本宠物遗传学研究所2024年的基因测序证实，紫仓的TYRP1基因（控制真黑素合成）表达量与其他色型仓鼠无显著差异。

饲养实践中可观察到，幼年紫仓出生时即具备深色眼睛，这与白化品种仓鼠的粉色虹膜形成鲜明对比。北京动物园小型哺乳动物馆长达15年的繁殖记录显示，紫仓群体从未出现眼睛颜色变异个体。值得注意的是，在特定光线条件下，健康紫仓的眼睛可能呈现暗红色反光，这是视网膜血管层的正常光学现象，不可与白化个体的虹膜缺色混淆。

环境因素对眼睛颜色的影响微乎其微。上海实验动物资源中心曾进行对照实验，将同窝紫仓幼体分别饲养在不同光照环境中，经6个月观察，所有个体眼睛颜色均保持稳定。该研究结果发表于《中国比较医学杂志》2024年第3期，证实外部条件不会改变既定遗传性状。

紫仓的黑色眼睛是其稳定的品种特征，这种性状由多组保守基因共同调控，在人工选育过程中未被改变。饲养者在选购时应注意，宣称具有"异色瞳"的紫仓多为杂交个体或存在健康隐患，正规繁殖场出品的紫仓应始终保持一致的深色虹膜特征。