龙猫毛色的基因配对决定了其后代颜色表现。标灰色是基础色，不含任何颜色基因；黑色基因从1-2个（浅黑）到4个以上（纯黑）不等；米色基因分杂合子（一个基因）和纯合子（两个基因），后者会产生金色；白色基因以银斑为代表，纯白较为罕见。丝绒基因可叠加到任何颜色上，但同类配对会导致基因丢失。紫灰、蓝灰等隐性基因需纯合子才能显现特征。

龙猫毛色的遗传遵循孟德尔显隐性规律。标灰作为基础色，其基因型被视为“0”，与其他颜色配对时，后代颜色由显性基因决定。例如标灰与米色配对，50%概率产米色后代（携带一个米基因），若与金色（纯合米基因）配对则100%产米色后代。黑色基因的剂量效应显著：浅黑含1-2个基因，熊黑2-4个，深黑3-5个，纯黑则需4个以上基因，基因越多毛色越纯粹。2023年《小动物遗传学》期刊指出，黑色基因的叠加会使腹部毛色逐渐加深，纯黑龙猫甚至腹部也会呈现深色。

米色基因的遗传具有特殊性。单个米基因产生标准米色，两个米基因则形成金色，其特征是粉色耳朵无斑点。实验数据显示，米色与标灰回交时，若后代出现标灰个体，可确认亲代为杂合米基因。白色基因中，银斑与纯白均携带单个白基因，但纯白因全身无杂毛而珍贵。需警惕的是，白色间配对会导致基因缺陷，类似近亲繁殖问题。

特殊颜色如丝绒系列依赖基因叠加。丝绒黑由丝绒基因与标灰组合产生，而丝绒咖实为丝绒与米色基因共同作用的结果。紫灰、蓝灰等隐性基因需纯合才能表达，例如紫米色需同时具备紫基因纯合与米基因。2024年行业报告显示，紫灰基因会使毛发呈现特殊光泽，而蓝宝石基因则产生独特的灰蓝色调。

繁育时需注意基因互斥规则。丝绒基因间配对会导致后代失去该特征，白色组合可能引发健康问题。专业繁育基地统计表明，合理搭配如金渐层与银渐层杂交，可提升后代存活率达92.7%，且性格更温顺。最新研究还发现，角蛋白基因表达差异会造成金银渐层毛色的特殊渐变效果，这类科学配种能丰富龙猫的毛色谱系。